Fue fundada como puerto fluvial el 25 de abril de 1867 cuando aún pertenecía a Perú, y en un comienzo se llamó San Antonio, nombrada así por el capitán peruano Benigno Bustamante, quien era Gobernador de Loreto (Perú). El 15 de diciembre de ese año el puerto cambió de nombre a Leticia, por el ingeniero Manuel Charón, en honor a Leticia Smith, su esposa. Este ingeniero era muy conocido e importante en la localidad.

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